Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ppfia3P60469 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ppfia3P60469 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms