Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uchl4P58321 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms