Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AFDNP55196 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AFDNP55196 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFDNP55196 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFDNP55196 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFDNP55196 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AFDNP55196 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFDNP55196 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFDNP55196 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AFDNP55196 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AFDNP55196 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AFDNP55196 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms