Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Mmp9P41245 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Mmp9P41245 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Mmp9P41245 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Mmp9P41245 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mmp9P41245 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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