Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ddit3P35639 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ddit3P35639 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms