Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm26736-201ENSMUST00000180425 1236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 AC155266.1-201ENSMUST00000220762 904 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hoxa2P31245 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hoxa2P31245 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms