Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RxrgP28705 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RxrgP28705 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RxrgP28705 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms