Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PparaP23204 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
PparaP23204 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PparaP23204 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms