Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VimP20152 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VimP20152 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VimP20152 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VimP20152 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VimP20152 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
VimP20152 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VimP20152 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VimP20152 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VimP20152 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VimP20152 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms