Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RGPD1P0DJD0 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RGPD1P0DJD0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms