Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Itgb1P09055 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Itgb1P09055 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms