Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pja1O55176 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pja1O55176 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pja1O55176 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms