Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
CrxO54751 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
CrxO54751 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CrxO54751 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms