Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ccer2J3QPU5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccer2J3QPU5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144 ms