Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ9

Gm20873, Predicted gene, 20873, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20873J3QMQ9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Gm20873J3QMQ9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm20873J3QMQ9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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