Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pcf11G3X9Z4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcf11G3X9Z4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms