Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pdzd2E9Q1M1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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