Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Calcoco2A2A6M5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Calcoco2A2A6M5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms