Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gria4Q9Z2W8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gria4Q9Z2W8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gria4Q9Z2W8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gria4Q9Z2W8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 329.5 ms