Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Pdpk1Q9Z2A0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdpk1Q9Z2A0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdpk1Q9Z2A0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdpk1Q9Z2A0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms