Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ilf3Q9Z1X4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ilf3Q9Z1X4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ilf3Q9Z1X4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms