Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cldn9Q9Z0S7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cldn9Q9Z0S7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cldn9Q9Z0S7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cldn9Q9Z0S7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cldn9Q9Z0S7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.8 ms