Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
S1pr4Q9Z0L1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
S1pr4Q9Z0L1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
S1pr4Q9Z0L1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
S1pr4Q9Z0L1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
S1pr4Q9Z0L1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
S1pr4Q9Z0L1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
S1pr4Q9Z0L1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
S1pr4Q9Z0L1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms