Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27,26■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27,24■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,95
Pmfbp1Q9WVQ0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,19■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,19■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27,18■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27,16■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Pmfbp1Q9WVQ0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,11■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Pmfbp1Q9WVQ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27,05■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27,03■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,92
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pmfbp1Q9WVQ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pmfbp1Q9WVQ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC27,01■■□□□ 1,91
Pmfbp1Q9WVQ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Pmfbp1Q9WVQ0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Pmfbp1Q9WVQ0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Pmfbp1Q9WVQ0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms