Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ArcQ9WV31 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ArcQ9WV31 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArcQ9WV31 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
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ArcQ9WV31 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
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ArcQ9WV31 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
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ArcQ9WV31 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ArcQ9WV31 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ArcQ9WV31 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.4 ms