Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skp1Q9WTX5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Skp1Q9WTX5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Skp1Q9WTX5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Skp1Q9WTX5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms