Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh13Q9WTR5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh13Q9WTR5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh13Q9WTR5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh13Q9WTR5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms