Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1T2

Sae1, SUMO-activating enzyme subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sae1Q9R1T2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sae1Q9R1T2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sae1Q9R1T2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sae1Q9R1T2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sae1Q9R1T2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms