Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Psmb2Q9R1P3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Psmb2Q9R1P3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Psmb2Q9R1P3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb2Q9R1P3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb2Q9R1P3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb2Q9R1P3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb2Q9R1P3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb2Q9R1P3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb2Q9R1P3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psmb2Q9R1P3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.9 ms