Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ntn3Q9R1A3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ntn3Q9R1A3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ntn3Q9R1A3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ntn3Q9R1A3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms