Protein–RNA interactions for Protein: Q9R155

Slc26a4, Pendrin, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc26a4Q9R155 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Slc26a4Q9R155 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Slc26a4Q9R155 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slc26a4Q9R155 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slc26a4Q9R155 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms