Protein–RNA interactions for Protein: Q9R100

Cdh17, Cadherin-17, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh17Q9R100 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh17Q9R100 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh17Q9R100 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh17Q9R100 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh17Q9R100 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms