Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
Lamc3Q9R0B6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.83
Lamc3Q9R0B6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3.83
Lamc3Q9R0B6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
Lamc3Q9R0B6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
Lamc3Q9R0B6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Lamc3Q9R0B6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
Lamc3Q9R0B6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
Lamc3Q9R0B6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
Lamc3Q9R0B6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Lamc3Q9R0B6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
Lamc3Q9R0B6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Lamc3Q9R0B6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Lamc3Q9R0B6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
Lamc3Q9R0B6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Lamc3Q9R0B6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Lamc3Q9R0B6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
Lamc3Q9R0B6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC38.86■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
Lamc3Q9R0B6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Lamc3Q9R0B6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Lamc3Q9R0B6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lamc3Q9R0B6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.63■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Lamc3Q9R0B6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Lamc3Q9R0B6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.6 ms