Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ripk3Q9QZL0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ripk3Q9QZL0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ripk3Q9QZL0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ripk3Q9QZL0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ripk3Q9QZL0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ripk3Q9QZL0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms