Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ChmlQ9QZD5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ChmlQ9QZD5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ChmlQ9QZD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ChmlQ9QZD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms