Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pkp3Q9QY23 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pkp3Q9QY23 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pkp3Q9QY23 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pkp3Q9QY23 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms