Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUQ5

Trpc4, Short transient receptor potential channel 4, mousemouse

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Length 974 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4Q9QUQ5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trpc4Q9QUQ5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trpc4Q9QUQ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpc4Q9QUQ5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc4Q9QUQ5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
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