Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dkk3Q9QUN9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Dkk3Q9QUN9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Dkk3Q9QUN9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk3Q9QUN9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk3Q9QUN9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms