Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN5

Prl3c1, Prolactin-3C1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prl3c1Q9QUN5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prl3c1Q9QUN5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prl3c1Q9QUN5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prl3c1Q9QUN5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prl3c1Q9QUN5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prl3c1Q9QUN5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prl3c1Q9QUN5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Prl3c1Q9QUN5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prl3c1Q9QUN5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Prl3c1Q9QUN5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Prl3c1Q9QUN5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prl3c1Q9QUN5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms