Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nkain4Q9JMG4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkain4Q9JMG4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkain4Q9JMG4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkain4Q9JMG4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nkain4Q9JMG4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms