Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC8

Epb41l4b, Band 4.1-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4bQ9JMC8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Epb41l4bQ9JMC8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Epb41l4bQ9JMC8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Epb41l4bQ9JMC8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Epb41l4bQ9JMC8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l4bQ9JMC8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l4bQ9JMC8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Epb41l4bQ9JMC8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms