Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gkap1Q9JMB0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gkap1Q9JMB0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gkap1Q9JMB0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms