Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trpc4apQ9JLV2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trpc4apQ9JLV2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpc4apQ9JLV2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpc4apQ9JLV2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms