Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nectin3Q9JLB9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nectin3Q9JLB9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Nectin3Q9JLB9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Nectin3Q9JLB9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms