Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKL4

Ndufaf3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ndufaf3Q9JKL4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ndufaf3Q9JKL4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ndufaf3Q9JKL4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ndufaf3Q9JKL4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms