Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nectin1Q9JKF6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nectin1Q9JKF6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nectin1Q9JKF6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Nectin1Q9JKF6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nectin1Q9JKF6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Nectin1Q9JKF6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Nectin1Q9JKF6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin1Q9JKF6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin1Q9JKF6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin1Q9JKF6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin1Q9JKF6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin1Q9JKF6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin1Q9JKF6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Nectin1Q9JKF6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225 ms