Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpa33Q9JKA5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpa33Q9JKA5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gpa33Q9JKA5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms