Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Oxct2aQ9JJN4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Oxct2aQ9JJN4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Oxct2aQ9JJN4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Oxct2aQ9JJN4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Oxct2aQ9JJN4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms