Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM1

Slc29a1, Equilibrative nucleoside transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc29a1Q9JIM1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Slc29a1Q9JIM1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc29a1Q9JIM1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc29a1Q9JIM1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc29a1Q9JIM1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc29a1Q9JIM1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc29a1Q9JIM1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc29a1Q9JIM1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc29a1Q9JIM1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc29a1Q9JIM1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms