Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIH2

Nup50, Nuclear pore complex protein Nup50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup50Q9JIH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nup50Q9JIH2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nup50Q9JIH2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nup50Q9JIH2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Nup50Q9JIH2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nup50Q9JIH2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms